Jonti Gentoo raconte l'histoire d'un petit pingouin qui parcourt le monde avec beaucoup de courage dans ses bagages, toujours avec un objectif fixe en tête. Le curieux Jonti se faufile hors du zoo la nuit après que ses tantes lui ont parlé du pôle Sud, où vivent de nombreux autres manchots papous, comme lui. Parce qu’il est déterminé, il doit y aller. Cependant, Jonti ne s'attendait pas à ce que dans sa recherche, il se lance dans l'aventure de sa vie - où non seulement les dangers le guettent, mais aussi de nouvelles amitiés surgissent. Parviendra-t-il à se dandiner jusqu'au poteau qui l'a visé ?